Gene regulation motif

多種不同的複雜網路,如生物網路、社群網路、電腦網路等,均可分割為比較小的網路模組,一般稱為網路基序(Network Motif)。這些網路基序常有著有意義的的動態表現並且在網路中扮演重要的角色,透過深入分析生物網路上的網路基序,可能得以進ㄧ步暸解許多重要的生物過程,我們以KEGG資料庫中22種人類癌症網路為例,在統計上有顯著的差異時(Statistical significance),則可定義為網路基序,探討網路基序之結構,或許能在形成癌症結構的過程中揭示重要資訊。 為了呈現我們的研究結果,我們基於網頁平台來查詢我們的數據與統計結果,可以分別對22種不同的癌症網路,24種不同的訊號傳遞網路,3點與4點的網路基序查詢它們在網路中的表現情形,我們也標示出每種基序是由那些基因所組成,搭配運用Cytoscape軟體,以視覺化的方式來呈現這些網路基序,另外搭配內部MicroRNAs、Transcription factors資料庫,與外部miRBase與NCBI網站連結,以提供生物學者進一步探究基因所關係到的屬性與機能。


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