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  本站記錄了各個人類的成熟miRna序列標靶在致癌基因(OnCoGene, OCG)及抑癌基因(Tumor Suppressor Gene, TSG)的位置,以及其能量大小,進而推算OCG及TSG在被人

類的基因標靶後,哪些位置會有較大的能量釋放,若是致癌基因時,會因為這些基因不表達而導致癌症、若是抑癌基因時,會因為這些基因異常表達而引起癌症,記錄了這些位置

的特性後,針對這些位置加以研究,以利OCG及TSG的藥物發展,達到正確治療癌症的目的。

 

查詢系統相關名詞說明:

 OCG:OnCoGene,致癌基因。當miRNA扮演致癌基因時,miRNA的增加會標靶TSG基因,而由於這些基因不表達而導致癌症。

 TSG:Tumor Suppressor Gene,抑癌基因。當miRNA扮演抑癌基因時,因miRNA的減少導致標靶OCG基因的可能性降低,導致OCG基因異常表達而引起癌症。

 miRNA:MicroRMA,普遍存在於動、植物及病毒的基因體中的分子RNA,在基因轉譯成蛋白質過程中扮演重要的角色,本網站使用Mature的Human之miRNA。

 mRNA:messenge RNA,本網站使用NCBI下載之OCG以及TSG的mRNA。

 Gene ID:該條mRNA之Gene ID。

 Refseq ID:mRNA的另外一種別稱,fasta格式的名稱。

 Score:進行miRNA與mRNA標靶並Hit時,所得到的最高分數。越高代表越好。

 MFE:所釋放之自由結合能,由於是釋放出能量,固此值為負數。越低越好。

 Z-score:進行miRNA與mRNA標靶並Hit時,所得到的統計有效度。

 miRNA Position:此條成熟人類miRNA與mRNA標靶的位置。

 mRNA Position:此條OCG/TSG與miRNA標靶之位置。

 mRNA Length:此條OCG/TSG之mRNA的總長度。

 3'UTR':從5'端至miRNA結合位置長度除上mRNA全長所得的百分比。

 Canonical:只考慮A-u及c-G互補之百分比。

 Wobble:加入非傳統G-u互補後之百分比。

 Align Length:與miRNA互補之mRNA片段的長度

本站最近更新日期 2010/1/4